在决算收入方面，中央财政拨款1750322.5万元，事业收入1142672.63万元，事业单位经营收入47902.52万元，其他收入132091.29万元。2010年用事业基金弥补收支差额42757.39万元，年初结转1033149.6万元。在决算支出中，教育支出118286.42万元，科学技术支出2834783.24万元，地震灾后恢复重建支出8612.43万元，住房保障支出119846.51万元。2010年结余分配109487.28万元，结转下年950287.86万元。

　　中科院同时公布2010年财政拨款支出为1848616.98万元，其中科学技术支出1627377.19万元，主要用于科技创新活动、国家重点实验室、国家重大科技基础设施运行及设备购置、人才队伍建设和研究生培养、在职及离退休人员工资和单位日常运转等支出；住房保障支出113287.35万元，用于按照国家规定标准为职工发放的住房公积金、提租补贴和购房补贴支出；教育支出92524.63万元，主要用于中国科学技术大学学生教育培养、日常运行等支出；地震灾后恢复重建支出8612.43万元。

　　中科院在决算情况说明中表示，2010年该院在关系我国产业结构调整、国际竞争力和国家安全的战略高技术领域，关系经济社会全面协调可持续发展和人民生命健康的重大公益性科技创新领域，在对科技发展和我国长远发展意义重大的重要基础前沿研究领域，取得一大批重大创新成果；一批重大科技成果实现技术转移和产业化，取得显著社会经济效益。

　　中科院是国务院直属事业单位，现有132个二级预算单位，截至2010年底，全院在职人员62278名，离退休人员48250名，在校学生56238名，博士后2936名，访问学者280名。