（1）在我国，商标权有专门的商标法保护； 而商号权仅比照民法通则关于企业名称权的保护方法保护。
（2）带有某公司商号标记的含注册商标的商品销售到另一国家时，销售人有必要就其商标在另一国家注册，却没有必要就其商号再行注册。 当有些企业将自己的商号注册成商标使用，或者将已注册的商标变更登记为企业的商号，商标和商号就成为同一内容或是其中的一个组成部分。这都是《商标法》、《公司法》及《企业登记管理条例》所允许的。 但是在更多的情况下，由于很多商号名称不具有显著特征，所以不宜也不能注册成商标。
（3）商标主要是用来区别商品的，代表着商品的信誉，必须与其所依附的某些特定商品相联系而存在，商标权属知识产权；商号主要是用来区别企业的，代表着厂商的信誉，必须与商品的生产者或经营者相联系而存在，商号权属名称权，所以商号权与人身或身份联系更紧密。
（4）商标按照《商标法》的规定进行注册和使用，具有专用权。其专用权在全国范围内有效，并有法定的时效性；商号按照《公司法》或《企业登记管理条例》登记注册，同样具有专用权。其专用权在所登记的工商行政管理机关管辖的地域范围内有效，并与企业同生同灭。